Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms