Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HSF1Q00613 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms