Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD1P98174 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD1P98174 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD1P98174 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD1P98174 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD1P98174 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD1P98174 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD1P98174 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD1P98174 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD1P98174 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD1P98174 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD1P98174 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD1P98174 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD1P98174 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD1P98174 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD1P98174 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD1P98174 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD1P98174 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD1P98174 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD1P98174 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGD1P98174 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FGD1P98174 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FGD1P98174 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FGD1P98174 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FGD1P98174 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FGD1P98174 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGD1P98174 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGD1P98174 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD1P98174 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD1P98174 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD1P98174 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD1P98174 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD1P98174 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD1P98174 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD1P98174 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD1P98174 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms