Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEP78395 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEP78395 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEP78395 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEP78395 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEP78395 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEP78395 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEP78395 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEP78395 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEP78395 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEP78395 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEP78395 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEP78395 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEP78395 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEP78395 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEP78395 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEP78395 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRAMEP78395 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRAMEP78395 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRAMEP78395 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRAMEP78395 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms