Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HBBP68871 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HBBP68871 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HBBP68871 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HBBP68871 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HBBP68871 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms