Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAP1AP62834 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAP1AP62834 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAP1AP62834 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAP1AP62834 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAP1AP62834 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAP1AP62834 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAP1AP62834 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAP1AP62834 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAP1AP62834 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAP1AP62834 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAP1AP62834 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAP1AP62834 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms