Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNRPD2P62316 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms