Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RPS29P62273 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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