Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VBP1P61758 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VBP1P61758 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms