Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARF3P61204 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARF3P61204 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARF3P61204 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms