Protein–RNA interactions for Protein: P60520

GABARAPL2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL2P60520 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABARAPL2P60520 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GABARAPL2P60520 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms