Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK1P57059 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK1P57059 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIK1P57059 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK1P57059 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK1P57059 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK1P57059 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK1P57059 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK1P57059 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK1P57059 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK1P57059 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK1P57059 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK1P57059 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK1P57059 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK1P57059 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK1P57059 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK1P57059 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK1P57059 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK1P57059 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK1P57059 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK1P57059 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIK1P57059 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK1P57059 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK1P57059 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK1P57059 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK1P57059 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK1P57059 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK1P57059 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK1P57059 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK1P57059 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK1P57059 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK1P57059 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK1P57059 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK1P57059 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK1P57059 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK1P57059 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK1P57059 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK1P57059 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIK1P57059 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIK1P57059 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIK1P57059 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIK1P57059 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK1P57059 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK1P57059 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK1P57059 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK1P57059 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK1P57059 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK1P57059 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK1P57059 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK1P57059 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SIK1P57059 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms