Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GFRA1P56159 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms