Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AIF1P55008 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AIF1P55008 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AIF1P55008 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
AIF1P55008 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AIF1P55008 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AIF1P55008 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AIF1P55008 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AIF1P55008 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
AIF1P55008 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AIF1P55008 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AIF1P55008 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AIF1P55008 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AIF1P55008 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
AIF1P55008 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AIF1P55008 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AIF1P55008 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AIF1P55008 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AIF1P55008 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AIF1P55008 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AIF1P55008 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AIF1P55008 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
AIF1P55008 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AIF1P55008 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AIF1P55008 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AIF1P55008 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AIF1P55008 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AIF1P55008 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AIF1P55008 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AIF1P55008 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AIF1P55008 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AIF1P55008 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AIF1P55008 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AIF1P55008 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AIF1P55008 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AIF1P55008 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AIF1P55008 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AIF1P55008 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AIF1P55008 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AIF1P55008 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AIF1P55008 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AIF1P55008 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms