Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB5CP51148 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms