Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ETV1P50549 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV1P50549 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV1P50549 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV1P50549 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV1P50549 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV1P50549 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV1P50549 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV1P50549 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV1P50549 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV1P50549 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV1P50549 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV1P50549 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV1P50549 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV1P50549 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV1P50549 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms