Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF6P49848 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF6P49848 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF6P49848 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF6P49848 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF6P49848 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF6P49848 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TAF6P49848 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TAF6P49848 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TAF6P49848 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TAF6P49848 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TAF6P49848 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TAF6P49848 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TAF6P49848 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms