Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRP9P49458 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRP9P49458 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRP9P49458 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRP9P49458 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRP9P49458 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRP9P49458 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRP9P49458 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRP9P49458 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms