Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK1A1P48729 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms