Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARCN1P48444 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms