Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms