Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPOP42166 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPOP42166 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPOP42166 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPOP42166 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPOP42166 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPOP42166 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPOP42166 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPOP42166 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPOP42166 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPOP42166 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPOP42166 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPOP42166 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPOP42166 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPOP42166 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPOP42166 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPOP42166 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPOP42166 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPOP42166 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPOP42166 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPOP42166 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPOP42166 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPOP42166 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPOP42166 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPOP42166 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPOP42166 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPOP42166 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPOP42166 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPOP42166 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPOP42166 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPOP42166 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPOP42166 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPOP42166 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPOP42166 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPOP42166 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPOP42166 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPOP42166 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPOP42166 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPOP42166 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPOP42166 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPOP42166 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPOP42166 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPOP42166 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPOP42166 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPOP42166 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPOP42166 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPOP42166 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPOP42166 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPOP42166 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPOP42166 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPOP42166 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPOP42166 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPOP42166 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPOP42166 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPOP42166 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPOP42166 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPOP42166 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPOP42166 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPOP42166 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPOP42166 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPOP42166 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPOP42166 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPOP42166 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPOP42166 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPOP42166 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPOP42166 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPOP42166 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPOP42166 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPOP42166 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPOP42166 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms