Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2IP36954 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms