Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATP6V1E1P36543 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1E1P36543 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms