Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COPB2P35606 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPB2P35606 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPB2P35606 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPB2P35606 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms