Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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HOXD13P35453 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD13P35453 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD13P35453 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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