Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXD12P35452 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms