Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
THBS4P35443 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
THBS4P35443 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
THBS4P35443 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
THBS4P35443 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
THBS4P35443 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
THBS4P35443 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
THBS4P35443 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
THBS4P35443 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
THBS4P35443 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
THBS4P35443 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms