Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPC1P35052 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPC1P35052 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPC1P35052 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPC1P35052 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPC1P35052 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPC1P35052 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPC1P35052 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPC1P35052 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPC1P35052 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPC1P35052 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPC1P35052 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPC1P35052 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms