Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCR1P32246 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCR1P32246 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCR1P32246 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCR1P32246 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCR1P32246 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCR1P32246 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCR1P32246 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCR1P32246 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCR1P32246 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCR1P32246 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCR1P32246 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CCR1P32246 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCR1P32246 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCR1P32246 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCR1P32246 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCR1P32246 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCR1P32246 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCR1P32246 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCR1P32246 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCR1P32246 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCR1P32246 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCR1P32246 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCR1P32246 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCR1P32246 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCR1P32246 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCR1P32246 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCR1P32246 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCR1P32246 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCR1P32246 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCR1P32246 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCR1P32246 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCR1P32246 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCR1P32246 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCR1P32246 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCR1P32246 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCR1P32246 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCR1P32246 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCR1P32246 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCR1P32246 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCR1P32246 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCR1P32246 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCR1P32246 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCR1P32246 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCR1P32246 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms