Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
OTX2P32243 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX2P32243 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX2P32243 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms