Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKBRP32239 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms