Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCKARP32238 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKARP32238 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKARP32238 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKARP32238 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKARP32238 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKARP32238 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKARP32238 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKARP32238 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKARP32238 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKARP32238 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKARP32238 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKARP32238 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKARP32238 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKARP32238 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKARP32238 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKARP32238 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms