Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA5P31644 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms