Protein–RNA interactions for Protein: P30939

HTR1F, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1FP30939 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1FP30939 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR1FP30939 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms