Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms