Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD1P28340 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD1P28340 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLD1P28340 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD1P28340 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms