Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms