Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB4P28070 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.4 ms