Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4AP27815 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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