Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA3P25788 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms