Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
APCP25054 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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APCP25054 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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APCP25054 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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APCP25054 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APCP25054 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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APCP25054 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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APCP25054 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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APCP25054 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
APCP25054 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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APCP25054 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
APCP25054 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
APCP25054 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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APCP25054 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
APCP25054 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
APCP25054 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
APCP25054 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
APCP25054 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
APCP25054 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
APCP25054 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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APCP25054 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
APCP25054 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APCP25054 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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