Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF1P22415 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF1P22415 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF1P22415 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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