Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA1P21709 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms