Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1P21675 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1P21675 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1P21675 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1P21675 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1P21675 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1P21675 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1P21675 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1P21675 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1P21675 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1P21675 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1P21675 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1P21675 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1P21675 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1P21675 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1P21675 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1P21675 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1P21675 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1P21675 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1P21675 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms