Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK11BP21127 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK11BP21127 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms