Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LMNB1P20700 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms