Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms