Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC1P18754 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC1P18754 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC1P18754 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC1P18754 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC1P18754 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC1P18754 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC1P18754 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC1P18754 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC1P18754 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC1P18754 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC1P18754 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC1P18754 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC1P18754 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC1P18754 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC1P18754 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC1P18754 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC1P18754 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RCC1P18754 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RCC1P18754 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RCC1P18754 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RCC1P18754 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RCC1P18754 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RCC1P18754 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RCC1P18754 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RCC1P18754 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RCC1P18754 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms