Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RLBP1P12271 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms